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病原微生物宏基因組檢測

| 背景概述


感染性疾?。ㄒ卜Q感染?。┦侨虬l病率和死亡率最高的疾病之一。病原體感染的復雜多樣,新發病原體的不斷涌現,細菌耐藥的嚴峻形勢,老傳染病死灰復燃等,給感染性疾病防控診療帶來了巨大挑戰。在臨床診療方面,約有20-60%的重癥肺炎,發熱待查,膿毒血癥和中樞神經系統感染患者不能明確感染病原體,造成嚴重的醫療,經濟和社會負擔。因此,快速、準確的病原體鑒定是有效治療、病情監測和控制疾病蔓延的重要前提!

傳統的病原微生物檢測方法主要包括形態學檢測、培養分離、生化檢測、免疫學和核酸檢測。因操作簡單、快速、技術要求不高,同時具有一定的診斷敏感性和特異性,目前仍在臨床上廣泛使用。但傳統的檢測方法在敏感性、特異性、時效性、信息量等方面存在局限,而且對于未知或者罕見的病原微生物,無法快速識別。

宏基因組測序(metagenomics next generation sequencing, mNGS)技術不依賴于傳統的微生物培養,直接對全血、肺泡灌洗液、腦脊液等臨床標本中的核酸進行高通量測序,通過與微生物參考序列數據庫進行比對分析,獲得疑似致病微生物的種屬信息。mNGS無需特異性擴增,無偏向性地快速鑒定細菌、真菌、病毒和寄生蟲等病原體,在未知或罕見病原體鑒定、耐藥基因譜分析、混合病原菌感染檢測等方面展現出廣闊的應用前景,尤其適用于急危重癥和疑難感染的診斷。


| 服務內容


檢測范圍:采用mNGS技術對臨床標本核酸進行廣譜的病原微生物篩查,可檢測范圍包括基因組序列已知的10100+種微生物,包括細菌(含分枝桿菌、支原體/衣原體)、真菌 、DNA病毒、寄生蟲等。

可檢測微生物種類

種類數目

細菌

6600+

真菌

980+

DNA病毒

2300+

寄生蟲

220+

合計

10100+


檢測適應癥:

① 疑“難”:長期不明原因發熱,感染病因不明;

② ?!爸亍保褐匕Y肺炎、腦膜炎,膿毒血癥等;

③ “特”殊:器官移植、腫瘤患者、免疫缺陷患者等特殊人群;


| 檢測周期

自實驗室收到標本確認合格后,1-3個工作日出具檢測報告


| 檢測優勢/適用人群

產品優勢:

1、 自主開發,專業分析,權威解讀

1) 自主開發的核酸提取試劑盒,覆蓋多種標本類型,可實現微生物的高效提??;

2) 自主開發的宏基因組信息分析軟件,實現高效專業的生信分析,采用雙重人工復核,高校辨別真假陽性病原體;

3) 綜合參考多個權威數據庫和大量的文獻資料,建立微生物參考序列和微生物致病信息解讀兩大專業數據庫和解讀報告軟件,實現病原微生物的快速識別和解讀;


2、兩大平臺,強強聯合,準確可靠

NGS+qPCR兩大平臺,強強聯合,互相驗證,提高陽性檢出率和準確性。


| 樣本類型


標本類型

標本體積

儲存及運輸條件

外周血

3-5ml

常溫(15-25℃)保存及運輸,2天內送檢

肺泡灌洗液

3ml以上

DNA檢測:-20℃保存 1

周,-80℃長期保存避免反復凍融 ,干冰運輸;


腦脊液

3ml以上

膿腫

3ml以上

胸腹水

3ml以上

尿液

10ml左右

其他無菌體液

3ml以上



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